目前临床上对于卵巢巧克力囊肿术后的患者，可以选择皮下注射亮丙瑞林或者是戈舍瑞林，连续用药三到六个月的时间，可以使体内残留的子宫内膜移位的病灶坏死，从而降低它的复发甚至不复发。但是临床上如果有生育要求的女性，也可以在手术后三个月积极的备孕。如果怀孕了那么女性在怀孕期间是不来月经的，这样会引起残留的子宫内膜异位病灶可能会出现坏死消失。如果患有卵巢巧克力囊肿的患者，临床上主要表现为进行性加重的痛经，而且囊肿会导致盆腔内环境的改变会出现粘连甚至影响怀孕。所以一般建议存在巧克力囊肿的患者，一般发现后应该积极的给予治疗，可以采取腹腔镜微创手术的方式，这种方式对机体的损伤较小。

目前在临床上，对于卵巢巧克力囊肿的治疗方式主要包括两种，第一种是腹腔镜下的手术治疗，第二种是开腹手术治疗。开腹手术治疗可以进行卵巢囊肿的剥除，附件的切除；而腹腔镜也可以进行这些手术。对于卵巢囊巧克力囊肿的患者，如果有生育要求，而且年轻的女性，尽量要进行腹腔镜下或者是开腹手术下巧克力囊肿的剥除术，要保留其卵巢和输卵管。对于没有生育要求或者绝经后的女性，则可以考虑进行患侧的输卵管、卵巢的切除手术等。女性在平时的日常生活中应该多休息，注意腹部的保暖。而采用腹腔镜手术，具有以下的优点，手术创伤小，病人术后恢复较快，住院时间短，而且术后切口瘢痕较小，美观的特点。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，是指具有生长功能的子宫内膜组织出现在卵巢的雌激素依赖性疾病。卵巢的巧克力囊肿和多囊卵巢综合症是越来越多见，可能和白领女性的工作压力大、生活节奏快、熬夜导致内分泌失调有关系。卵巢的巧克力囊肿的学名叫卵巢的子宫内膜异位囊肿，是正常的宫腔内的子宫内膜因为内分泌的失调，异位到卵巢上，慢慢的随着每个月月经的脱落、出血形成卵巢上的囊肿。卵巢的巧克力囊肿，属于一种卵巢的良性疾病，但也有一定的恶变率，但恶变率很低。卵巢的巧克力囊肿绝大多数都是在育龄女性身上出现，在B超上的表现是卵巢的囊性的包块，的囊壁比较厚，囊液不均质的，常常提示是内分泌失调造成。治疗是腹腔镜下做囊肿剔除，卵巢的巧克力囊肿剔除是卵巢巧克力囊肿治疗上的金标准，可以开腹做。因为卵巢巧克力囊肿可以造成盆腔内的粘连，可以造成女性不怀孕，所以现在越来越受重视。

一般来讲卵巢的巧克力囊肿都是由子宫内膜异位症造成的。那么卵巢的子宫内膜异位囊肿它的恶变率大概1%左右很低，一般常常我们在发现这个卵巢的囊肿直径超过10公分的时候，B超提示囊内壁不均匀的时候，那么医生要高度的警惕是否有恶变的可能。卵巢的子宫内膜异位症，它的恶变率一般在1%左右，那么除了卵巢的子宫内膜异位症以外，比如说卵巢的浆液性囊腺瘤或者是黏性囊腺瘤，伴随囊内出血，那么在这个时候它的恶性程度就要远远高于卵巢的子宫内膜异位症。因为有些卵巢的恶性肿瘤常常会有囊内出血，在这时候它的囊内液也可能是那种巧克力色的。那么在这个时候它就有可能本身就是一个恶性卵巢的囊肿卵巢的恶性的肿瘤，所以在这个时候我们应该高度警惕。那么对于那些有卵巢囊肿的患者，做B超的时候囊内可能会有一些不均匀的回声，当它的直径大于10个厘米的时候，那么我们更应该警惕它是否有恶性的可能。

巧克力囊肿会自愈吗？如果说这个囊肿是一个卵巢的子宫内膜异位囊肿。是因为雌孕激素水平而导致的卵巢巧克力囊肿，当这个患者不再分泌雌性激素水平的时候，也就是说，当患者绝经以后，这个囊肿不会再长，而且随着时间的延长。囊内的液体成分会慢慢的被吸收，囊肿的体积会相应的有所缩小，这时候因为它没有了雌性激素刺激它不再长大，甚至会逐渐缩小，可以从这个角度来讲，可以说可以自愈的，但是如果这个患者她是一个生育年龄的妇女，她卵巢分泌雌孕激素水平，它是不会自愈的，这个巧克力囊肿只能会越来越大，如果我们不进行临床的干预。不可能自愈，卵巢巧克力囊肿自愈的前提一定是她卵巢不再分泌雌性激素水平。不再分泌雌性激素了，它才会出现自愈的这种迹象，否则卵巢巧克力囊肿是不会自愈的，除非我用药物去控制上，但是如果应用了药物就不属于自愈了。