非溃疡性消化不良患者大多有焦虑、抑郁、不安和疑病症(尤其是对癌症的恐惧)。有少数出现失眠、神经紧张、言语夸张等神经系统症状，患者经常描述自己的病情很严重，其后果似乎无法想象，整日忧心忡忡。精神因素通过自主神经系统从而影响胃肠道的运动、分泌和血液供应，最终导致非溃疡性消化不良的发生。