双肾多发囊肿称为肾囊肿，肾囊肿可以分为单纯性和复杂性，需要结合患者具体的影像学检查加以判断。
单纯性肾囊肿不是先天性或者遗传性疾病，而是后天形成的。一般认为单纯性肾囊肿来源于肾小管憩室，随着年龄的增长，憩室会越来越多，这也可以解释为什么随着年龄的增长，肾囊肿的发病率也是在增高的情况。单纯性肾囊肿大多数没有明显症状，对肾功能和周围的组织影响也不大，因此不需要特殊的治疗。一般每半年到一年复查腹部超声，肾脏超声就可以。如果囊肿直径比较大，大于5cm或者产生了周围组织的压迫的时候，可能会引起尿路梗阻或者血管压迫，这种情况下是需要进行外科治疗的，可以进行囊液的抽吸术或者是手术的治疗，一般是没有药物能够消除肾囊肿的。
复杂性肾囊肿是指囊肿存在钙化、出血、感染、分隔以及囊壁增厚等情况，需要进一步请泌尿外科就诊，明确疾病的诊断。
根据CT肾囊肿有Bosniak分级，共有四级，一级称为单纯性肾囊肿，属于良性。二级是轻度复杂肾囊肿，良性多见。三级是较复杂的肾囊肿，良恶性不明确。四级是恶性的肾囊肿，所以建议双侧多发囊肿，还是及时就诊，明确诊断。