肾结石有体外冲击波的碎石、输尿管软镜手术、经皮肾镜的手术和腹腔镜切开取石等手术方式。
肾结石的治疗需要通过很多的因素，比如患者一般状况、结石的大小、肾脏是否有积水，这些因素都决定了是否采取积极的治疗方法。一般情况下没有症状的肾结石、结石负荷不大，没有造成肾积水和感染的这些情况。那么一般的这种肾结石是可以通过保守治疗、多饮水、多运动、口服药物、肾结石有可能自己排出来，那么是对于症状性的结石或者已经造成肾积水的结石，就需要积极的治疗。
常常推荐对于小于两公分的结石，患者可以首选一个体外冲击波的碎石，因为这种碎石的方法在门诊进行，在体表没有任何的切口，非常的微创。碎石之后，这些结石会变成小的这种碎石颗粒，可以慢慢的自己排出来。
对于体外碎石不成功或者不适合做体外碎石的这些患者，患者可以做输尿管软镜手术。通过这种尿道肾镜的进到肾盂之后，然后找到结石，激光把结石碎掉，碎成小的碎块状或者粉末状，这样就可以让结石自行排出，那么对于软镜还有经皮肾镜都不适合的患者，需要患者做经皮肾镜的治疗了。
对于大于两厘米的结石，首选还是经皮肾镜的手术，这个需要在肾脏上打一个洞，然后通过镜子进去之后用激光等能量平台把结石碎掉，这种手术可能会造成肾脏的出血，重者可能会危及患者的生命。此外，还可以通过腹腔镜的切开取石或者开放手术来把结石取出，并可以同时处理存在的输尿管狭窄等问题。