毛囊炎是由于感染性因素引起，主要是细菌等病原微生物感染导致，比如金黄色葡萄球菌，与皮肤外伤、不良习惯有关。
引起毛囊炎原因有很多种，主要是由于感染性因素而导致炎症的发生。感染性毛囊炎可能由于细菌等病原微生物感染导致，常见细菌是金黄色葡萄球菌。
这种细菌平时位于人体皮肤或鼻腔黏膜表面，不会对人体造成伤害。如果皮肤或毛囊受到了损伤、刺激，或毛囊发生瘀滞，就可能造成细菌进入皮肤内部，形成感染，导致毛囊炎的发生。而除皮肤外伤，还可能和患者的不良习惯有关，比如有拔除毛发的习惯，或由于患者刮胡子。
有的人可能由于穿了紧身的衣服，造成皮肤摩擦，刺激了毛囊，也造成炎症。有的人是由于多汗或化妆品等因素堵塞了毛囊，造成毛囊的炎症。
患者如果出现在脸部或胸部部位，可能会形成毛囊皮脂腺炎，又叫做痤疮。形成原因和患者的内分泌机能紊乱，以及免疫机能下降等有关，造成皮肤对细菌的防护能力下降，所以产生毛囊炎症，可能造成局部红肿现象。