甲状腺穿刺是一个微创手术，它的危险性很小，基本上对身体没有明显的损害。可能会对身体造成一定的危害。
一、疼痛，在穿刺时，有针刺感肯定有一定的疼痛，但一般不严重，可以忍受，并且在做穿刺时用麻药，所以说疼痛一般不会很明显。
二、如果穿刺不恰当，或出血比较多，血供比较丰富的情况下，可能会出现出血，或引起血肿。有一定出血的概率，但一般出血量比较少。穿刺后压迫可以止血，形成血肿相对比较小。
三、可能发生感染，但感染的发生率是很低的。一般只要严格按照无菌操作规范，就不会发生。
四、可能有其他的病发症，比如气管的损伤，喉返神经的麻痹等等。如果在穿刺时患者配合不好，可能会出现这种情况。但一般这种穿刺时间比较短，患者一般配合的很好。所以这种损伤出现的几率很小。