乙肝可以达到临床治愈，不能彻底根治。
乙型肝炎现在还没有一个彻底的能够根治的治疗药物上市，但是通过一些研究调查，发现乙型肝炎病人也会有表面抗原消失，甚至表面抗体出现的情况。这种情况称为临床治愈，或者称为功能性治愈。现在看来在治疗药物中，用干扰素进行治疗，获得这种表面抗原转阴的几率会稍微高一些。
在一些特殊选择的人群中，比如说表面抗原水平非常低，乙肝病毒DNA水平非常低，而且有一次明显的炎症发作，转氨酶水平大于200以上，这些人经过长期的干扰素治疗之后，可能会有30%左右甚至更高的人会出现表面抗原的转阴，甚至表面抗体的出现。
所以对于乙肝病人来说，虽然现在还没有一个彻底治愈的药物上市，但还是可以通过长期的抗病毒治疗，来达到功能性治愈。虽然有这种可能，但也不能够让所有的病人在治疗开始的时候就去追求功能性治愈的目标。现在临床上认为只要长期的抗病毒治疗过程中，乙肝病毒DNA阴性，也就是乙肝病毒不再复制，那么患者的肝功能会长期地保持稳定，同时也不向肝硬化和肝癌发展。这个阶段称为维持治疗的一个成功，而维持治疗应该是大多数肝炎发作的乙肝病人所追求的一个长期治疗的稳定方案。
意味着医生经过努力，可能会让30%的人彻底的从身体内部把乙肝病毒清除掉，可能达到停药的标准，不需要再用药。但是对于大部分人来说，即对于70%的乙肝病人来说，可能还是需要长期的治疗。但是不论达到了功能性治愈还是长期治疗能够保持HBV-DNA阴性的人，将来再发生肝硬化、肝癌这种恶性的终末期肝病事件的可能性都会非常低。