两者在病因，临床表现，以及在治疗上都有很明显的区别。
急性咽喉炎主要是一个感染性的疾病，那么病因上主要是病毒或者是细菌的感染造成的。那么而慢性咽喉炎，首先他的病因他有可能由急性的咽喉炎反复发作，造成的慢性咽炎，还有它的病因还包括，比如说他会有周围的器官的炎症，比如说鼻炎、鼻窦炎等等也可以诱发，还有他有一些烟酒过度、粉尘、有害气体的刺激，或者甚至包括一些过敏等因素，这些是慢性咽喉炎的病因。
在临床表现上，急性咽喉炎主要的最常见的一个临床表现是咽痛，早上疼，疼痛剧烈的时候有可能还会引起耳头疼。那么还有急性咽喉炎发作的时候，通常会伴有一些全身症状，比如说发烧、头痛、全身的乏力、恶心、呕吐等等。而慢性咽喉炎最常见的表现不是咽痛，而是咽部的异物感或者咽部的痒感、烧灼感等等。而且慢性咽喉炎通常不会有全身性的症状。
在治疗方面也不太一样，急性咽喉炎的治疗，主要以抗生素治疗、抗感染治疗为主，那么同时可以采用一些含片或者是一些中成药来作为局部治疗，对症治疗。而慢性咽喉炎通常治疗中是不建议使用抗生素的。慢性咽喉炎的这个治疗第一是去除病因，尤其是戒烟、戒酒，积极治疗一些急性咽炎，或者是鼻腔的一些炎症，纠正一些不良的生活习惯等等。还有他的局部治疗主要是可以用这个局部的含片，或者是一些口服的中药，还有一些雾化吸入的治疗为主，那么有部分的慢性肥厚性的咽炎的病人，也可以采用一些电凝或者是冷冻或者是激光的这种治疗方式。这一点和急性咽炎也是有所区别的。