皮肤瘀斑、血尿、肾脏出血。患有肾结石、输尿管结石甚至是膀胱结石，都可以做体外碎石，但是体外碎石也有部分副作用。
体外碎石是用冲击波经过人体的皮肤到皮下组织，然后一直到达目标组织，结石在输尿管的时候，冲击波会通过输尿管击中结石，如果结石在肾里面，冲击波会通过肾的实质击中结石，因此，冲击波经过路径的所有组织都可能会损伤，所以患者在体外碎石后，有可能会出现皮肤瘀斑，但瘀斑会慢慢吸收。
如果比较严重，输尿管受损，情况较轻的患者输尿管会有点出血，造成血尿，会持续一两天；严重的输尿管管壁可能会被击破。如果是肾损伤，损伤较轻，同样可能会有尿血，严重的会肾脏出血。
另外，体外冲击波碎石如果患者结石有继发感染的情况或者继发有积水的情况，最好不要首选体外碎石，因为体外冲击波碎石可能会加重感染，造成重度感染，对患者生命会有影响。