感染衣原体肺炎的病人，通常会出现的症状有发热、咳嗽、喉咙疼等，青少年则会有咽喉炎，鼻窦炎，脑炎等并发症，成年人会有冠心病，哮喘等并发症。沙眼衣原体肺炎患者会咳嗽、呼吸急促，鹦鹉热衣原体肺炎患者会高烧、咳嗽、食欲不振，肺炎衣原体肺炎患者咳嗽时间比较长，还有支气管炎、咽炎等并发症出现。