良性纵隔肿瘤的后遗症主要是与手术有关或者侵犯其他周围的组织导致。如果进行微创手术，一般伤口较小，病人能够快速的愈合，如果是传统的手术，此时一般损伤较大，难以恢复，疼痛较为剧烈，也有可能压迫其他的地方，如声带，可能导致喉咙嘶哑。