慢性腹泻的病程一般是两个月以上，如果连续两个月都出现了腹泻的症状，可以被称为是慢性腹泻；除此之外，如果腹泻发作的时间不长，但是在一年内累计发作超过了三个月，也可以被称为慢性腹泻。如果在这期间出现的食物中毒、消化不良或肠道疾病，就可能会使慢性腹泻的病程延长。

导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

导致慢性腹泻的原因之一就是消化系统疾病，比较常见的有肠道感染性疾病、肠道非感染性疾病，也包括肝胆胰腺类疾病。甲状腺功能亢进症、慢性肾上腺皮质功能减退等内分泌代谢性疾病也容易引发慢性腹泻，另外，慢性腹泻的发病和某些免疫性疾病也有关系。

大多数患者会出现慢性腹泻，主要是因为消化不良、受到感染、脂肪吸收不良或食物中毒所造成的，例如经常吃一些油腻且不容易消化或腐烂的食物，就很容易导致腹泻发烧。除此之外，还有部分患者是因为本身就患有肠道疾病所引起的慢性腹泻，这都需要尽早接受治疗。

慢性腹泻一般会导致大便次数明显增多，具有排便次数多且较急的特点，且大便状态也会变得异常，可呈现出大便溏稀、颜色较浅和粪便量少等诸多特征，往往会夹杂有少量粘液或脓血。另外，不少患者可出现发烧腹痛等全身性反应，还会并发营养不良和中毒性肝炎。