通常情况下，脑炎是由于各种病原微生物包括病毒，细菌，真菌，螺旋体，寄生虫等，侵犯了脑实质而导致的急慢性炎症，根据病原菌的不同预后也不同，一般病毒性脑炎的预后比较好。只有极少数会留下后遗症，结核性脑膜炎，早期诊断早期治疗预后也不错，化脓性脑膜炎部分会留下后遗症，隐球菌性脑膜炎比较严重，预后较差，还有另外一种少见的朊蛋白病死亡率非常高。