寄生是在体表或体内的下等真核生物，称为人体寄生虫。人体寄生虫种类繁多，可寄生于人体任何部位，这些寄生虫的检测方法主要是取感染者的粪便，检查寄生虫的卵，只要有卵，就可以诊断。肠道原生动物，比如蓝氏贾第鞭毛虫，溶组织内阿米巴，是便检包囊。还有血原虫，如疟原虫，采集感染者的血液，检查疟原虫各个阶段的生活史。