当发烧的时候肌肉疼有可能是呼吸道炎症感染引起的，当出现这种情况的时候需要配合医生吃一些清热和退烧的药物来进行治疗。发烧有可能是自身的免疫力低下引起的，也有可能是身体内受到病毒或者是细菌感染引起的，平时要注意个人的卫生。