全身检查：肛瘘虽然是局部病变，但也与一般情况或某些疾病有关，不容忽视。活动性肺结核患者常发生肛瘘，术后伤口愈合缓慢。骶髂结核患者的肛瘘可能是由骨结核引起的。结直肠炎症性疾病，如非特异性溃疡性结肠炎，可合并肛瘘。应重视复杂肛瘘的系统检查、细菌培养及必要时抗生素敏感性试验、血沉及血象改变。如有必要，应进行病理检查，以确定肛瘘的性质，并观察是否有癌变。