肛周脓肿的形成，主要和感染有关。是由大多数的厌氧杆菌和少数金葡菌、和球葡菌引起了胰腺感染，会导致粪食在肛瘘里堵住，堵塞了肛腺分泌接口，但分泌还在继续，且一但分泌旺盛，就会引起肿胀，此时细菌侵入后，就会形成脓肿。上火、辛辣饮食、饮酒等外界因素也可引起肛周脓肿。