由于可引起手足口病的病毒种类较多，目前还没有可以预防手足口病的疫苗。因此，主要的预防措施就是教育公众认识手足口病，讲究卫生，加强管理，注意消毒隔离。

手足口病流行期间，托幼机构及小学加强晨检工作，及时发现病例。发现患有疱疹的患儿，应立即动员家长对其进行家庭隔离治疗，直至病愈方可返校。托幼机构应每日对玩具、用具等进行清洗消毒，减少间接接触传播。

儿童用过的餐具可以煮沸消毒，儿童玩具可以通过清洗，或使用甲醛及含氯的消毒剂消毒，被褥可经紫外线照射消毒。家长、老师和保育员应注意室内通风换气，保持室内空气新鲜，协助或督促儿童饭前便后洗手，不要让孩子吃手或啃咬玩具，不与別人共用毛巾、牙刷、手帕和餐具，避免病从口入。

在流行期间，家长要少带孩子去人多的公共场所，减少被感染机会。要保证孩子有充足的睡眠，鼓励母乳喂养，加强营养，多饮水，经常参加室外活动，提高孩子的抵抗力。孩子的被褥和衣服要保持清洁和干燥，经常在阳光下晾晒。

出现发热、出疹等症状及时就诊，病孩应该在家隔离休息，避免传染给其他儿童。家长应严密观察孩子的病情变化，病情严重的孩子一定要及时送往医院治疗，避免严重并发症的发生。

手足口病的预防工作应开始于早春疾病尚未流行时，加强监测，发现早期病例，早隔离，早治疗，防患于未然，预防得越早越好，避免疫情扩大和严重病例的发生。