事实上，葡萄胎的真正发病原因不明。病例对照研究发现，葡萄胎的发生与营养状况、社会经济及年龄有关。病因学中年龄是一显着相关因素，年龄大于40岁者葡萄胎发生率比年轻妇女高10倍，年龄小于加岁也是发生完全性葡萄胎的高危因素，这两个年龄阶段妇女易有受精缺陷。部分性葡萄胎与孕妇年龄无关。

1、完全性葡萄胎：胎盘绒毛全部受累，无胎儿及其附属物，宫腔内充满水泡;就算只有1只精虫进入卵子也可能会发生问题，若是妈妈的卵子是个“空包蛋”，就会造成染色体异常，因为只有爸爸的染色体不断的在进行分裂，也会造成滋养层不断增生，却没有胎儿的情形。同样的，若是2只精虫同时进入空卵，也会发生这样的情形。这种情况称之为完全性葡萄胎。

完全性葡萄胎可能与地域、种族、营养、社会经济因素及妊娠年龄等因素有关。

(1)饮食中缺乏维生素A及其前体胡萝卜素和动物脂肪者发生葡萄胎的几率显着升高。

(2)年龄是另一高危因素，大于35岁和40岁的妇女妊娠时葡萄胎发生率分别是年轻妇女的2倍和7.5倍。相反，小于20岁妇女的葡萄胎发生率也显着升高。

(3)前次妊娠有葡萄胎史也是高危因素，有过1次和2次葡萄胎妊娠史者，再次葡萄胎的发生率分别为百分之一和百分之十五到二十。

2、部分性葡萄胎：葡萄胎有一种情况，就是因为同时有2只精虫进入到卵子里，无法发展出正常的胎儿，但是滋养层细胞却持续的增长。这样便会造成初期的胎儿与过度增长的滋养层细胞，同时存在于子宫中，仅部分胎盘绒毛发生水泡状变性，宫腔内尚有存活或已死的胚胎。在自然流产的组织中发现百分之四十病人有一定的水泡样变性，但不诊断为葡萄胎。

部分性葡萄胎可能与使用口服避孕药及月经失调有关。但和年龄及饮食因素无关。不论是完全性还是部分性葡萄胎，多余的父源基因物质是造成滋养细胞增生的主要原因，极少数部分性葡萄胎的核型为四倍体，但其形成机制尚不清楚。